Secuenciación del genoma de la Sigatoka

El pasado  6 de junio la mexicana Caucasella Díaz, defendió su tesis doctoral titulada “Genética  y genómica funcional del patógeno de la Sigatoka negra del banano Pseudocercospora fijiensis” el evento se realizó en La universidad de Wageningen

Su tesis describe la finalización de la secuenciación del genoma de este hongo devastador que amenaza las exportaciones de banano en todo el mundo, así como el desarrollo de un protocolo de transformación genética que se utilizó para descubrir nuevos mecanismos de resistencia a los fungicidas en el hongo.

Leer más: http://edepot.wur.nl/449585

 

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Einar Martínez de la Parte se une al equipo de Wageningen – Banana


Desde el 21 de noviembre de 2017 Einar Martínez, del Instituto de Investigaciones en Sanidad Vegetal (INISAV), Cuba, comenzó su proyecto de doctorado sobre la enfermedad de Panamá en el banano. En Cuba, se cultivan más de 179,000 ha de bananos y plátanos, que se utilizan principalmente como alimento básico. Su investigación se centrará en la diversidad de Fusarium oxysporum f.sp. cubense en Cuba. Además, evaluará la resistencia en el germoplasma de banano cubano, desentrañará el concepto de raza en Foc y estudiará el papel del microbioma para el control de la enfermedad.

El proyecto de Einar fue financiado por NUFFIC, la organización holandesa para la internacionalización en educación.

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Inauguración Prof. Gert Kema

El banano se ha visto gravemente afectado por enfermedades fúngicas que solo se pueden combatir utilizando cada vez más productos fitosanitarios. En el siglo pasado, la muy amada variedad de banano conocida como Gros Michel fue aniquilada como resultado de la enfermedad del Mal de Panamá. Pero ahora la variedad de reemplazo Cavendish, disponible en todos los supermercados, está en riesgo. En su inauguración como profesor en una posición especial para Fitopatología Tropical en Wageningen University & Research el 21 de septiembre de 2017, el profesor Gert Kema reveló lo que se necesitará para salvar el banano.
La cátedra especial del Profesor Kema está financiada por la Fundación Dioraphte y auspiciada por el Laboratorio de Fitopatología.
https://www.wur.nl/en/newsarticle/Banana-has-a-future-after-all-1.htm

 

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El primer banana tipo Cavendish resistente al marchitamiento por Fusarium raza 4 tropical

Investigadores de la Universidad Tecnológica de Queensland en Brisbane, Australia, han diseñado bananos Cavendish modificados genéticamente con resistencia a la devastadora enfermedad. Esta enfermedad es causada por el hongo Fusarium oxysporum f.sp. cubense raza 4 tropical (TR4) y también se  conoce como marchitez por Fusarium del banano. Científicos de la Universidad e Investigación de Wageningen en los Países Bajos validaron los datos de campo.

En la primera prueba de campo conocida con plantas de banano genéticamente modificadas realizadas en suelo fuertemente infestado con TR4, una línea de Cavendish transformada con un gen tomado de un banano silvestre persistió completamente libre de TR4, mientras que otras tres líneas mostraron resistencia parcial. Los resultados acaban de ser publicados en Nature Communications < https://www.nature.com/articles/s41467-017-01670-6> .

El equipo clonó el gen llamado RGA2 del progenitor silvestre de plátanos comestibles, Musa acuminata ssp. malaccensis, que tiene una notable resistencia a TR4. Una línea Cavendish modificada (RGA2-3) permaneció libre de TR4 durante los tres años que duro la prueba. Igualmente, otras tres líneas modificadas con RGA2 mostraron una fuerte resistencia, con un 20% o menos de plantas que exhiben síntomas de la enfermedad durante un período de tres años. Por el contrario, entre el 67% y el 100% de los bananos usados como control fueron infectados o severamente infectados por TR4 después de tres años, esta prueba en campo incluyo también la  variedad somaclonal de Cavendish Gigante conocida como GCTCV-218, que actualmente se considera resistente a TR4.
Desde 2012 hasta 2015, la prueba de campo fue dirigida por el distinguido profesor James Dale de la Universidad de Tecnología de Queensland. Se llevó a cabo en una plantación de banano comercial a las afueras de Humpty Doo en el Territorio del Norte en Australia previamente afectada por TR4. El suelo también fue fuertemente reinfestado con la enfermedad para este ensayo.

“Avance absoluto”
El equipo de investigación de Gert Kema, profesor de fitopatología tropical en Wageningen University & Research, se asoció en el proyecto. “Las líneas de banana GM muestran que la actividad del gen RGA2 está fuertemente correlacionada con el nivel de resistencia a TR4”, comenta Kema. “Este es un gran avance ya que se trata del primer gen de resistencia identificado asociado a la enfermedad”. Sin embargo, esto es solo el comienzo, algo de luz al final del túnel. El siguiente paso es desplegar la inmensa diversidad de bananos silvestres para diversificar la fruta y establecer una producción de banano resistente y sostenible para todos. En 2012, determinamos que esta especie de banano tiene una valiosa resistencia a TR4 y el grupo del Profesor Dale ahora ha confirmado esto clonando el gen subyacente. Nuestro papel fue validar las infecciones del hongo utilizando las técnicas moleculares que desarrollamos para detectar y cuantificar TR4 “.
Aunque se ha encontrado que los bananos Cavendish también tienen este gen RGA2 de forma natural, no es muy activo en las plantas susceptibles. Una nueva investigación está estudiando cómo ‘activar’ el gen en bananos Cavendish para que sean resistentes a TR4.
Los investigadores comenzaron una prueba de campo ampliada en la misma plantación, cultivando las cuatro líneas resistentes de RGA2 y las líneas recientemente desarrolladas de variedades modificadas de Grand Nain y Williams Cavendish. Tienen la capacidad de seleccionar hasta 9,000 plantas para resistencia y determinar rendimientos y otros rasgos importantes en los próximos cinco años.

Los coautores con el profesor James Dale el profesor Gert Kema, Fernando García-Bastidas (Universidad de Wageningen e Investigación, Países Bajos), el Dr. Anthony James (QUT), el Dr. Jean-Yves Paul (QUT), el Dr. Harjeet Khanna (Sugar Research Australia, anteriormente QUT), Mark Smith (Darwin Banana Farming Company), Dr. Santy Peraza-Echeverria (CICY, México, anteriormente QUT), Profesor Peter Waterhouse (QUT), Distinguido Profesor Kerrie Mengersen (QUT) y Profesor Robert Harding (QUT).

 

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Uniendo fuerzas con Rahan Meristem

Rahan Meristem y el Centro de Investigación de la Universidad de Wageningen participan en un proyecto dirigido a identificar bananos del grupo Cavendish con resistencia a la enfermedad del mal de Panamá o la marchitez de Fusarium causada por Fusarium oxysporum f.sp. cubense raza 4 tropical.

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Proyecto de investigación KNAW-SPIN en el futuro del banano en Indonesia.

El equipo de investigación indonesio-holandés investiga las condiciones sociales, agroecológicas y biológicas para conservar la diversidad de bananos. Las bananas están profundamente arraigados en el paisaje indonesio y forman un ingrediente esencial del menú diario de las personas en las ciudades y el campo. Parece impensable que desaparezcan los diversos usos del banano, como comer o compartir bananos frescos, vender racimos a comerciantes locales, fabricar virutas de banana o envolver alimentos en hojas de plátano.

La colaboración de investigación internacional e interdisciplinaria centrada en la diversidad de bananos indonesios está financiada por la Real Academia Holandesa de Artes y Ciencias (KNAW) – Programa Científico Indonesia – Países Bajos (KNAW-SPIN) y una serie de becas a través de la Dirección General de Industria de Indonesia (DIKTI). El programa ofrece capacitación de cuatro candidatos de doctorado, tres becarios de investigación post-doctoral y un pequeño grupo de estudiantes de maestría indonesios. La asociación involucra a  la Universidad Gadjah Mada (UGM) en Yogyakarta, el Instituto Pertano Bogor (IPB) en Bogor, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) en Cibinong y las universidades de Wageningen y Ámsterdam (UvA). KNAW- El Instituto de Ecología de los Países Bajos (NIOO-KNAW) y el Instituto de Biodiversidad Fúngica KNAW-Westerdijk. El proyecto KNAW-SPIN sobre banano está coordinado por el profesor Gert Kema (WUR) y la profesora  Siti Subandiyah (UGM).

https://ugm.ac.id/en/news/12890-indonesian.and.dutch.researchers.study.banana.tree.disease
y
https://ugm.ac.id/id/berita/12885-kolaborasi.peneliti.indonesia.dan.belanda.meneliti.penyakit.pisang.di.indonesia
(bahasa lenguaje indonesio)

One of the locations on Central Java (Indonesia) where samples were taken

One of the locations on Central Java (Indonesia) where samples were taken (click image to see location)

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